本系教學重點在完整提供具國際標準化特色之課程與教學品質，所有教材內容須符合STCW典範課程，因此，教育部在民國95年底編審一套完整之我國航輪教材，內含航海系學生應修習之9本教材，加上地文與天文航海外部核定，共計11本，為我國大專航海系學生之標準用書，強烈建議學校教學、考試出題、學生閱讀學習，皆用此套教材。因此，為保證教學品質以及學生考證方便性，在航海系的教學中，這一套我國航輪教材為必備之教材。

本系制定STCW課程核心能力指標，讓本系學生透過一系列專業課程的學習，能更具專業與實務的競爭力。並經由DNV對此課程每年度皆做稽核，確保課程皆符合STCW之規範與要求。